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共话AI4S下药物研发新变革:深势科技Hermite®夏季产品发布会圆满落幕

开拓创新的 深势科技 DP Technology 2024-03-28

近年来,人工智能技术的快速发展,为生命科学领域带来了新的可能性。作为AI for Science新范式的引领者和践行者,深势科技也在不断探索AI为药物设计带来的变革。5月27日,深势科技Hermite®夏季发布会在苏州圆满落幕。Hermite®致力于为药物研发工作者提供数据、算法、算力三位一体的一站式解决方案,通过提供有价值的计算设计工具,成为药物研发工作者的“手”、“眼”、“脑”。现场,众多业内重要专家和代表性企业齐聚,见证深势科技新算法成果及新一代药物计算设计平台Hermite®新功能的发布。同时,关于抗体、RNA及合成生物学三大热门领域的前沿思想,也在这里交汇、碰撞出新的火花。

会上,中国科学院院士、北京科学智能研究院院长鄂维南首先进行开场致辞。鄂维南表示:当前人工智能技术的应用已经成功的渗透到了各个领域。AI for Science作为引领当下科学技术革命的重要驱动力,正在为合成生物学以及抗体和RNA研究等在内的众多领域带来新的解决方案。开展这一类的研究,离不开分子模拟实验预测理论创新等等,这也是人工智能带来的新的机会所在。
鄂维南指出:AI for Science已经进入了预训练模型时代,这使得利用大数据和算法的力量对生物大分子进行深度挖掘变得更加可行和高效。通过构建生物网模型能够为分析生物大分子之间的相互作用、研究RNA的调控等等提供更加有力的支持。AI for Science的底层算法对于优化药物设计、预测药物的作用,降低药物研发成本具有很大的帮助,这也是深势科技在不断突破的重点方向之一。今天发布的 Hermite®生物大分子解决方案就是深势科技基于[多尺度建模+机器学习+高性能计算]等科学研究的新范式在微观工业设计领域推出的新产品。人工智能的技术发展已经逐步成熟,不过 AI 能为生命科学和生物医学做的远远不止于此。AI 技术在大分子相关研究中的应用还在不断完善。AI 模型的准确性和可靠性以及可解释性还需要进一步的提高,AI 技术和实验验证相结合将为药物研发持续提供更为可靠的依据。

随后,深势科技创始人兼CEO孙伟杰介绍了深势科技基于AI for Science的新算法
孙伟杰首先简单介绍了预训练模型的原理和应用。在大分子研发中,序列、结构、动力学这三类预训练模型都有非常大的开发空间。他陆续介绍了深势科技基于序列的结构和动力学预测、基于序列的蛋白性质预测、基于结构和动力学的蛋白性质预测,以及RNA结构预测等深势自研的多个性质预测模型,效果远超此前算法。孙伟杰表示,得益于包括DPA、Uni-Mol、Uni-Fold在内的一系列AI4S预训练模型的发展,当前我们在生物医药领域面临的机遇,就像2018年2019年泛AI领域面临的机遇一样,AI4S已进入预训练模型时代。深势科技将蓄力打造生物医药的GPT,为行业研发提供新起点。选择Hermite®,就是选择了强悍的组织保障,也是选择与AI新时代接轨
在强大算法体系的支撑下,深势科技的产品也在不断迭代、超越。Hermite®是深势科技近年来在AI for Science领域深耕和集大成的平台产品,去年10月,深势科技在上海重磅发布新一代药物计算设计平台Hermite®,如今,Hermite®迎来了全新升级

基于深势科技AI for Science新算法,公司药物设计平台产品负责人徐涛博士发布了Hermite®产品新功能。对于大分子研发领域,Hermite®新增生物大分子整体解决方案,实现了从序列分析到结构预测,结构预测到功能分析,及基于功能分析后的生物大分子设计的全流程功能。

在可视化方面,Hermite® 体验全新升级,新增的分子展示体验能够帮助药物研发科学家更好地展现、查看、构建和优化预测结果的2D和3D结构。
在小分子药物研发领域, 基于深势科技最新算法成果,Hermite®上线了Uni-QSAR,一个集合预训练模型的、多维度表征分子的、多模型自动集成的功能。基于Uni-Mol预训练模型,Uni-QSAR 不仅有效解决了传统QSAR领域中:有标签数据“稀缺”、分子表征能力低、手动调参、模型单一等挑战,其多模型集成的高效并行流程及资源调度模型,更极大降低了建模的成本,提高了建模的速度,在诸如分子性质预测等任务的标准测试下,结果达到SOTA[1]此外,Hermite®也进一步优化和丰富了其核心功能Uni-FEP,Uni-Aquasite的实际应用场景,提升了稳定性和准确性的同时,大幅提高平台操作友好性和便捷性。
围绕近期热门领域,大会还开展了生物药创新论坛、RNA前沿论坛、合成生物学论坛等三场别开生面的讨论,十余位嘉宾进行了深入交流、探讨。在上海交通大学药学院院长张翱的主持下,晶泰科技联合创始人&CEO马健、火山引擎医疗健康行业解决方案总监杨旭东、沙砾生物创始人&首席执行官刘雅容、华为云中国区生物医药行业总经理朴雪花、诺纳生物CTO何云围绕生物药创新展开了讨论。围绕RNA前沿话题,楷拓生物联合创始人&CEO王潇、砺博生物创始人&CEO詹剑、思合基因联合创始人党云琨、维亚生物高级副总裁蔡建华、艾博生物计算生物负责人陈荣华、竣莅医药创始人&CEO徐军、深势科技大分子研发负责人温翰进行了深入交流。在合成生物学论坛中,芯宿科技联合创始人&CSO董一名、丽合智造首席算法科学家邢华东、聚维元创联合创始人&CTO李承、斯道资本资深投资经理王博分享了各自观点。
新药研发长期背负着三座大山:高风险、高投入、长周期。近年来,行业痛点愈发显现、寻求突破愈发困难,药物研发工作者也亟需升级自己的“武器库”。深势科技基于AI for Science新范式,创新成果频出,未来也将在“持续创新,成就伙伴”的理念下,将Hermite®打造为新一代临床前药物设计综合整体解决方案。
点击视频,回顾更多发布会精彩瞬间:

参考文献

[1] Gao, Zhifeng, et al. "Uni-QSAR: an Auto-ML Tool for Molecular Property Prediction." arXiv preprint arXiv:2304.12239 (2023).

关于深势科技

深势科技是“AI for Science”科学研究范式的引领者和践行者,致力于运用人工智能和分子模拟算法,结合先进计算手段求解重要科学问题,为人类文明最基础的生物医药、能源、材料和信息科学与工程研究打造新一代微尺度工业设计和仿真平台。
我们开创性地提出了「多尺度建模+机器学习+高性能计算」的革命性科学研究新范式,并推出了Bohrium®微尺度科学计算云平台、Hermite®药物计算设计平台、RiDYMO™强化动力学平台及电池材料计算设计平台等微尺度工业设计基础设施,颠覆了现有研发模式,打造“计算引导实验、实验优化设计”的全新范式。

深势科技是国家高新技术企业、北京市“专精特新”中小企业,总部位于北京,并在上海、深圳等城市布局研发中心。科研技术团队由中国科学院院士领衔,汇集了超百位数学、物理、化学、生物、材料、计算机等多个领域的优秀青年科学家和工程师,其中公司的博士及博士后占比超过35%。核心成员获得过2020年全球计算机高性能计算领域的最高奖项“戈登贝尔奖”,相关工作当选2020年中国十大科技进展和全球AI领域十大技术突破。

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